南澳地处北回归线，属于南亚热带季风气候，海洋性气候明显，常年气候温和，光照充足，雨量偏少，热量丰富，霜冻很少。但常有台风、强风、干旱、寒露风、低温阴雨等灾害性的天气出现。

气温 各地累年平均气温在 20~22℃之间，滨海、洼地略高，山区略少。其趋势是：2 月上旬最低，2 月中旬至 3 月下旬缓慢回升，4 月上旬后明显上升，至 4 月下旬达22℃以上。7 月中旬，气温达 27℃以上。9 月中旬，逐渐下降，至 11 月上旬降至 22℃以下。一般年份最高为 32~34℃，最低为 4~6℃。

风  南澳全年最盛行的风为东北到东风，其次是偏南风为主，9 月至次年 4 月吹东北到东风。全年平均风速 4.1 米/秒，刮 8 级以上风力的天数，平均每年 86.2 天，最大风速为 52 米/秒。南澳受台风影响较多，最多年份达 11 次，最少 2 次，累年平均 5.7 次，一般出现在 7－10 月。

雨 南澳每年 5 月下旬至 6 月中旬，南方温暖空气凝集上空，水汽足，而北方的冷空气不时入侵，常形成锋面低槽等有利于降水的天气形势。这段时间是南澳前汛期降水峰期，雨量占全年的 20％。

2018年，南澳县年平均气温22.6℃，比常年高0.4℃，极端最高气温34.0℃（5月29日），极端最低气温6.6℃（2月6日）。全年总降水量1439.1mm，与常年持平，汛期（4—9月）降水量1135.5mm，占全年总降水量的8成。全年天气现象暴雨7天，大雾5天，轻雾132天，未出现高温天气。全年日照总时数2243.3小时，与常年持平。南澳县气象站录得8级以上大风19天。2018年有３个台风严重影响我县。８月２８日－３１日，受季风低压影响我县出现特大暴雨降水过程。９月中旬受２３号台风“山竹”影响，我县出现大到暴雨降水过程。１０月下旬受台风“玉兔”影响，我县出现８－９级、阵风１０级的大风，但未出现大的降水过程。